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基因芯片制造的新動力
日期:2025-05-12 13:42
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摘要:慕尼黑——那些需要制作自己的DNA芯片,而不是依賴昂貴的商業(yè)芯片的生物學(xué)家現(xiàn)在能夠更好地DIY工作了,這要歸功于位于柏林的德國基因組資源中心(RZPD)制造的一組人類DNA克隆。 芯片已經(jīng)日益廣泛地被從事基因表達研究的科學(xué)家所使用,因為芯片能夠幫助他們比較癌癥組織和非癌癥組織中數(shù)千個基因的活性。大多數(shù)商業(yè)芯片系統(tǒng)要包括數(shù)千個被稱為寡核苷酸的人造核苷酸短序列,這些序列能夠與由活性基因轉(zhuǎn)錄而來的特殊信使RNA(mRNA)連接。 但許多研究人員選擇利用逆轉(zhuǎn)錄酶,和直接來自mRNA的互補DNA(cDNA)來自己制造比較價廉的芯片。一旦...
慕尼黑——那些需要制作自己的DNA芯片,而不是依賴昂貴的商業(yè)芯片的生物學(xué)家現(xiàn)在能夠更好地DIY工作了,這要歸功于位于柏林的德國基因組資源中心(RZPD)制造的一組人類DNA克隆。
芯片已經(jīng)日益廣泛地被從事基因表達研究的科學(xué)家所使用,因為芯片能夠幫助他們比較癌癥組織和非癌癥組織中數(shù)千個基因的活性。大多數(shù)商業(yè)芯片系統(tǒng)要包括數(shù)千個被稱為寡核苷酸的人造核苷酸短序列,這些序列能夠與由活性基因轉(zhuǎn)錄而來的特殊信使RNA(mRNA)連接。
但許多研究人員選擇利用逆轉(zhuǎn)錄酶,和直接來自mRNA的互補DNA(cDNA)來自己制造比較價廉的芯片。一旦研究人員獲得了一個DNA庫,他們就能制造cDNA拷貝從而創(chuàng)造出許多芯片。
非盈利性組織——德國基因組資源中心表示,其人類cDNA組的質(zhì)量要比其他實驗室高,而且經(jīng)過排列。RZPD的一個客戶說,他們利用該中心cDNA克隆制造的芯片要比商業(yè)核苷酸芯片便宜很多。
RZPD的克隆具有許多優(yōu)勢。每個克隆經(jīng)過反復(fù)測序和校驗。而在大多數(shù)實驗室中大約有10%-20%樣本的標注不正確。RZPD還確保每個cDNA都代表了一個獨特的基因,而大多數(shù)cDNA實驗室往往包含特殊活性基因mRNA的多個拷貝。
Brigham的基因芯片中心的主任Steven Gullans說:“一個序列經(jīng)驗證、非隨機cDNA庫對依靠高質(zhì)量試劑進行生物學(xué)研究的人員來說簡直是一個奇跡?!?
RZPD的克隆組包含32000個基因,另外10000個將在未來幾個月中陸續(xù)加入——使其比其他基因庫擁有更多的基因。G?ttingen大學(xué)的生物化學(xué)家Jobst Landgrebe說:“將40000個左右的cDNA點上芯片就意味著我們能覆蓋絕大多數(shù)人類基因組?!彼a充說從這個cDNA組制造芯片的價格不超過75歐元。
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